Iquique tiene la primera opción de ganar el Torneo Nacional y lograr el primer título en su historia de esta categoría. Y un punto que hace valorar aún más lo que está realizando el equipo de Jaime Vera, es que también por primera vez, llega hasta el final del campeonato luchando por la corona.
El primer partido de Iquique en la serie mayor fue el 20 de abril de 1980 en el sin goles ante Green Cross, en Temuco. Siete días después obtuvo su primer triunfo, tras superar 5-2 a Everton, como local.
Su mejor actuación en Primera la cumplió en 1988 cuando se ubicó tercero entre 16 clubes. En esa temporada disputó su primera liguilla precopera, perdiendo en la final ante Colo Colo.
En su segunda participación liguillera (2013) clasificó a la Copa Sudamericana, al ubicarse segundo en el mini torneo, detrás de Universidad de Chile.
Suma tres títulos de Copa Chile. En 1980 venció 2-1 a Colo Colo en la final (en semifinales había eliminado por 1-0 a la U); en 2010 alcanzó la corona, luego de empatar a uno y vencer 4-3 por penales a Concepción; y en 2013 ganó 3-1 a Huachipato.
Además, registra tres títulos de Primera B: 1979, Clausura 1997 y 2010.
