En julio de 2014, Gustavo Canales regresó a Universidad de Chile para vivir lo que en ese momento esperaba como un segundo ciclo exitoso con los azules. Pero no pudo. Pese a sus esfuerzos y los del cuerpo médico, los problemas físicos no le permitieron cumplir con sus expectativas ni las del club que hoy dejó.

El 5 de octubre de 2014, Canales estaba feliz por haber recibido una nueva nominación a la selección chilena. Pero ese día se lesiona el hombro en el partido con Arica. El siguiente duelo era ante Colo Colo, y en la previa el atacante suma un esguince de tobillo. Pese a esa lesión juega igual, pero se nota que está disminuido y no es un aporte.

Y comenzaron los problemas que nunca terminaron. El pie izquierdo no lo dejó tranquilo, con un edema óseo y constantes inflamaciones en los tendones y en las articulaciones que rodean la zona afectada.

Así, le costaba mantener regularidad en el equipo. Su última racha de continuidad fue entre julio y octubre de 2015, con 17 partidos seguidos entre Apertura y Copa Chile. Después estuvo ausente en 12 encuentros consecutivos.

Los números del segundo ciclo azul de Canales:

Apertura 2014

PJ: 15

Goles: 9

Libertadores 2015

PJ: 5

Goles: 2

Clausura 2015

PJ: 10

Goles: 9

Apertura 2015

PJ: 8

Goles: 6

C. Chile 2015

PJ: 8

Goles: 6

Supercopa 2015

PJ: 1

Goles: 0

Clausura 2016

PJ: 9

Goles: 3

Libertadores 2016

PJ: 2

Goles: 0