Entre el 16 de diciembre de 1999 al 3 de marzo de 2003, José Antonio Gómez se desempeñó como ministro de Justicia (gobierno de Eduardo Frei y Ricardo Lagos) y hoy, luego de ser prencandidato presidencial por el Partido Radical, regresa  a la misma cartera por el gobierno de Michelle Bachelet.

El actual senador fue también subsecretario de Justicia en el comienzo del gobierno de Eduardo Frei, específicamente entre 1996 y 1999.

Este cargo lo obtuvo luego que en el año 1995, se desempeñara como asesor de la ministra de Justicia Soledad Alvear en materias penitenciarias.

El pasado 12 de diciembre, Gómez aseguró que estaba disponible para integrar el gabinete de Michelle Bachelet, en caso de que ella lo convocara.

"Si la presidenta Bachelet me pidiera que participe en su gobierno lo voy a hacer con toda claridad. Yo estoy porque le vaya bien a Chile y al programa de Michelle Bachelet, y si mi experiencia y trabajo sirven para eso lo haré con gusto", dijo.