Miguel Pinto fue clave en el Atlas de Guadalajara, luego de detener un remate en la tanda de penales ante los Alebrijes de Oaxaca con la que los "Zorros", que también contaron con Rodrigo Millar, clasificaron a la final de la Copa MX Apertura 2013.
Tras el 1-1 conseguido en los noventa minutos reglamentarios, la llave ante los de Oaxaca se debió definir en los lanzamientos desde los doce pasos.
Y fue acá donde el arquero nacional fue determinante al detener uno de los disparos del equipo rival, permitiendo el que sería el definitivo 4-3 en los penales y la clasificación a la final de la Copa MX Apertura 2013.
Justamente, en la definición el cuadro de Miguel Pinto y Rodrigo Millar se medirá ante el Morelia de Héctor Mancilla, que eliminó por su parte en semifinales al Monterrey de Humberto Suazo.