Participó activamente de la campaña presidencial de su padre, Marco Enríquez-Ominami , y entró a militar en el PRO, partido fundado por el excandidato.
Sin embargo, cuando ya han pasado casi siete meses desde las elecciones de noviembre de 2017, Fernanda Cornejo ha tomado distancia del PRO y, es más, según aseguran desde la colectividad, la hija de la conductora Karen Doggenweiler dejó de ser una militante activa en el partido.
En el PRO comentan que Cornejo quiso seguir la huella de ME-O, quien el 23 de mayo pasado anunció que se retiraba de la política en medio de su formalización por el caso SQM.
Por estos días, en cambio, Cornejo se ha enfocado a sus labores como activista dentro de la UDP, donde estudia Ciencias Políticas.